SimVector官方版是款针对图形图像所打造的质粒图谱绘制工具。SimVector电脑版支持绘制各种颜色、图案、字体和行类型的圆形和线性矢量地图,你可以随意在单个质粒图谱文本中的任何位置都可以使用多种字体和颜色进行编辑,同时还支持自定义矢量地图。SimVector还采用了直观清晰的用户界面,让大家这进行设计或者绘制的过程中,更加的方便快捷。
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SimVector软件功能
一、计划克隆实验
1、设计网关克隆实验:使用SimVector,您可以执行构成 Gateway®克隆的BP和LR反应。供体载体和表达载体是BP反应和产生进入克隆所必需的。LR反应和生成表达载体需要入口载体和目标载体。
2、设计TA克隆载体:SimVector可以轻松设计 TA克隆实验。TA克隆向导接受商业T载体或限制性设计的T载体,并将其与经修饰的PCR产物组合。然后,您可以生成高度准确的重组DNA质粒图谱。
3、进行限制性克隆:克隆技术需要限制性酶切割载体分子和待克隆的分子。SimVector执行限制酶分析,并允许您对所需序列上的限制酶进行过滤,注释和映射。
4、执行限制分析:使用超过1000种限制酶的综合数据库进行限制性分析。SimVector识别DNA序列中的限制酶识别位点,用于测定限制酶。提供两种酶过滤模式来指定限制性分析的参数。酶过滤使您能够设置酶标准以符合您的实验要求。为方便起见,包括来自20多家商业供应商的酶套。
二、绘制目录质量质粒图
1、绘制质粒图:用SimVector绘制出版质量质粒图。
2、多重克隆站点(MCS)显示:SimVector通过解释GenBank头文件注释(可用)来识别MCS,或者您可以手动指定。
3、支架视图显示:它甚至有聪明的只列出在MCS内切割的酶和其他地方。这种特殊格式我们称之为“括号视图”。
4、目录质量矢量图形: SimVector生成矢量图形格式的质粒图,用于导出到Adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002。
5、导出网络就绪图像:以JPEG,PNG和TIF格式导出高分辨率质粒图,便于网站添加,导出图像可以进行主机页面。
6、图形Entrez特性:将GenBank注释转换为图形特征(线性和圆形序列图)。
7、创建向量:创建向量图,而不知道其序列。
三、自定义矢量地图
1、简单样式:从数百种字体,颜色,样式和限制酶和功能的填充模式中选择一个按钮。
2、颜色主题:定义您自己的自定义颜色主题并重复应用。
3、选框选择:组选择对象以快速设置所有样式。
4、线性和圆形视图:显示圆形和线性质粒图。
5、缩放:放大查看详细图形或进行概览。
6、文本:添加文本以注释质粒图。
SimVector软件特色
1、绘制卓越的出版质量质粒图
无论您是销售工程质粒的目录公司还是对重组克隆实验进行限制性分析,SimVector将帮助您模拟实验,并从头至尾创建出版质量质粒图。使用软件绘制各种颜色,图案,字体和线条类型的圆形和线性质粒图。以斜体显示细菌部分的两种字体样式显示酶名称,如传统的。在质粒图中包含特征注释的任何位置,在单个文本字中使用多种字体样式和颜色。
2、多重克隆站点
矢量目录通常以独特的格式显示MCS,其中酶在垂直列表中一个上。SimVector通过解释GenBank标题注释来识别MCS,或者您可以手动指定它们。然后,它们以我们称为“括号视图”的特殊格式绘制。它甚至有聪明的人只列出在MCS和其他地方切割的酶。
3、闪电快速克隆模拟
SimVector将GenBank或本地文件的序列标题中的注释转换为完全说明的地图。克隆向导可以引导您完成流行的重组方案,例如Gateway克隆和TA克隆,以及一个和两个酶限制性克隆。ORF搜索可以帮助您确保构造保留在框架内。点击一个按钮,您可以翻译表达蛋白质的序列,以检查可能的阅读框错误。使用SimVector,克隆模拟就像点击几个按钮一样简单。
4、限制分析
SimVector具有全面的限制酶分析功能。从一千多种限制性酶的数据库中选择,或者使用我们预先加载的普遍的商业酶库。SimVector还使您可以构建自己的定制酶组。
5、生物学家设计的直观界面
SimVector具有直观的生物学家设计的界面,可进行限制性克隆和序列分析。点击向导使得即使对于初学者也很容易使用,而多功能功能可以完全控制专家绘制质粒图。
SimVector主要亮点
多克隆位点(MCS)展示
Vector目录通常以一个独特的格式显示MCS's,酶一个一个地显示在纵向表格中。SimVector通过解释GenBank头注释识别MCS's,或者您也可以直接指定他们。然后,他们会以“Bracket View”这种特殊的方式将位点展示出来。除此以外,它还可以列出只在MCS内剪切的酶。
快速的克隆模拟
SimVector将来自GeneBank或者本地文件的序列注释转换为注解详细的图谱。克隆向导可以帮助您通过普及的重组规则,如Gateway® 克隆,TA克隆以及一或两个的酶限制性克隆。ORF 搜索可以帮助您确保结构处于框架内。您可以点击按钮,翻译表达蛋白的序列以检查可能存在的阅读框错误。使用SimVector,克隆模拟变得非常简单,只需要点击几个按钮就可以完成。
限制性内切酶分析
SimVector 具有全面的限制性内切酶分析功能,从超过一千种限制性内切酶的数据库或预装的商业酶集里选择需要的酶。SimVector 还可以为您订制自己的酶集合。
生物学家设计直观界面
SimVector 有一个直观的可进行限制克隆和序列分析的生物学家设计界面。傻瓜式的操作令初学者也可以简单地进行操作。同时,其通用的功能确保专家学者们可以完全控制图谱的绘制。
SimVector安装方法
1、这本站下载站将您需要的附件包进行快速的下载,解压之后,点击SV460Installer.exe进行快速的安装;
2、正在进入软件的欢迎安装向导界面,请大家稍等一会即可......
3、软件已经准备好了进行安装,点击Next;
4、点击我接受软件的许可协议,点击Next;
5、软件的信息,支持进行查看阅读,点击Next;
6、选择软件的安装位置,建议安装在D盘,默认位置“C:Program Files (x86)SimVector 4.6”,点击Next;
7、simvector已经正在进行快速的安装,请耐心等待即可..........
8、simvector已经安装完成,点击Finish;
SimVector使用方法
SimVector可以模拟克隆实验并创建出版质量地图从开始到结束。用它来画圆和线性矢量地图在各种各样的颜色、图案、字体和行类型。显示酶在两种字体风格与细菌在斜体部分是传统。甚至比使用一个字体样式和颜色在一个文本字地图的任何地方包括功能注释。
不管你是公司销售工程质粒或目录执行限制分析重组克隆实验,SimVector将帮助您模拟实验和创建出版质量的质粒地图从开始到结束。使用该软件画圆和质粒线性映射在各种颜色,图案、字体和行类型。显示酶在两种字体风格与细菌在斜体部分,传统。甚至比使用一个字体样式和颜色在一个文本字在质粒的任何地方地图包括功能注释。
出口质粒以EPS格式地图Adobe Illustrator 10,SVG对微软点2002年或做好举办web页面。TIFF和选择JPEG,PNG格式用于出口。
向量目录通常显示MCS在一个独特的格式,与酶高于另一个垂直列表。SimVector标识解释基因库的MCS的头注释也可以手工指定它们。
然后它吸引他们在这个特殊格式我们称之为“托架视图”。它甚至有智慧只列出MCS内的酶切,其他什么地方也没去。
SimVector更新日志
1.将bug扫地出门进行到底
2.有史以来最稳定版本
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